新規プロジェクトの作成
Silverlightアプリケーションを新しいWebサイトでホストするをチェックした場合
ASP.NET Webアプリケーションプロジェクト
新しいWebサイト(ASP.NET Webアプリ)でホストすることにするとソリューションには、SilverlightアプリプロジェクトとASP.NET Webアプリプロジェクトが含まれます。
ASP.NET Webアプリプロジェクトがスタートプロジェクトになっているので、IDEから実行しようとするとASP.NET開発サーバーが立ち上がりWebページエラーが表示されてしまいます。
このダイアログがでたら一度実行を止めてIDEでソリューションのビルドを行ってから実行すれば正常に起動できます。
ASP.NET Webサイト
「ASP.NET Webアプリケーションプロジェクト」ではなく「ASP.NET Webサイト」でやればこのような問題は発生せずにIDEから実行すれば自動的にビルドされて立ち上がりました。
また、ASP.NET開発サーバについてもポート番号が固定化できますので、ASP.NET Webサイトの方が開発時のスタイルとしては好きです。

Silverlightアプリケーションを新しいWebサイトでホストするをチェックしない場合
html部分がすでにあってSilverlight部分だけ作りたいときはこちらを選びます。
この場合はWebサイトプロジェクトが追加されずソリューションにはSilverlightアプリケーションのプロジェクトだけなのでIDEから実行すればすぐにhtmlファイルとしてIEに表示されます。
