VOCALOID2のvsqファイルを解析して口の動きをシンクロさせるものにはRipSyncとLipsyncがあります。
TV会議システムなどで用いられるLip Syncronizationという音声とくちびるの動きを連動するように調整する仕組みと同じようなコンセプトで作成されたのだと思いますが、どちらもすばらしい出来です。
RipSyncで作られた動画の例
Lipsyncで作られた動画の例
MikuMikuDanceにも同様の機能がありますね。
http://blogs.wankuma.com/hatsune/archive/2008/03/16/127949.aspx