Windows Installer の version によって command line options が違っています。
Version 2.x まで Command-Line Options
Version 3.0 以降 Standard Installer Command-Line Options
Version 2.x の command line options を 3.0 以降でも support しているので、3.0 以降ではどちらでもよいわけですが。
なお、Technet にある reference の方では 2.x までの command line options しか載っていません。
Msiexec (command-line options)