ちょっとまとめる必要あり
今のところ以下の3点変更で動くと思います。
ハンドラとモジュールのロックを解除する（既報）
アプリケーションプールにクラシックモードのものを指定する。（IIS7マネージャのアプリケーションを選択して、操作の詳細設定のアプリケーションプールで選択。）
Web.configのHandlersのScriptResourceのものにpreCondition="integratedMode"を追加する。
2番目はIIS7からパイプラインの処理方法が変わったからというのでわかるのですが、回避策がありそうな気もします。
3番目は2番目の対策をするとIIS7のマネージャから操作することはできないので手で書いてください。（というか操作できてもそんな項目はないけど）
どうしてこんなに情報がないのか・・・