VISTAx64にただMySQL5.1（または5.0）のx64対応版をインストールすると、MySQLInstanceConfig.exeが動かない件についての対応。
以下やった手順
マニフェスト書き換え（？）が必要なことに気づく。mt.exeどこ？
↓
VS2008Expressインストール->mt入ってないことに気づく
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WindowsSDK導入->mtはbinとbin\x64にあった。x64を使用
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参考先をみてマニフェスト書き換え・・・も失敗。
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書き換え場所が違っていた模様
・「assemblyIdentity」の「processorArchitecture」がx86になってるのでこれを「*」に変更（ここ見る限りではamd64が正解なんかなぁ）
・「requestedExecutionLevel」は「level」に「requireAdministrator」が正解。
ちなみにlevelは「asInvoker」「highestAvailable」「requireAdministrator」が設定値としては正しいみたい。
マニフェストの書き換え（？）方法
・MySQLのbinへ移動。mt.exeをコピーしてくる（いや、パス通したりパス書くのがめんどくさかったもんで）
管理者権限なしのプロンプトでいけた
・「mt -inputresource:MySQLInstanceConfig.exe -out:manifest.txt」でテキストに出力
・テキストを開き、上記「assemblyIdentity」「requestedExecutionLevel」について記述を変更する
・「mt -manifest manifest.txt -outputresource:MySQLInstanceConfig.exe」
以上で起動を確認。MySQLめ、てこずらせやがってぇぇぇぇ
まぁmy.iniをおててで編集してscでサービス登録すればそれでいける気もするわけですが。