ブート構成データ エディタについてよく寄せられる質問によると、BIOS base の Windows Vista では "C:\Boot\BCD" に BCD の実体があるようですけど、これ Windows を起動していると完全な排他 lock がかかっていて読み込みすらできないようです。
で、ちょこちょこと調査してみると、掴んでいるのは Windows kernel。
Process Explorer で掴んでいる process は "System" と表示されています。
さらに調査してみる。。。
Default で registry に load されていることが判明。
完全な排他かかっていて読み込めないのは、NTUSER.dat と同じですね。
なお、対象の registry path はこの場所です。
HKEY_LOCAL_MACHINE\BCDXXXXXXXX
「XXXXXXXX」には 00000000 からの連番が入るようです。