MSDNはまだですわ。
http://www.microsoft.com/technet/technetmag/
UACとかはちゃっぴさんじゃなくっても必見
じったさんのセッションでも言ってたけど仮想化されるのは32ビットで管理者実行じゃなく、Vistaマニフェストがないと仮想化されると。
なので.NETで標準でコンパイルするとAnyCPUになるので、x64環境では仮想化されません。
仮想化されないと%systemroot%なんかへのアクセスは普通に失敗します。
x86でコンパイルすると仮想化されるので、アクセスは成功したかのように見えます。
このポイントも32bit - 64bitの動きの違いと言うことで語れるかもしれません。
でもマニフェストと、署名するなら一緒なのでみなさんの普通の環境では差異がでないはずです。（普通の環境という表現には大幅な誇張が認められます）