ステップ7シリーズ ASP.NET 2.0 を利用したマスタ ページによるページ テンプレートの実装
http://www.microsoft.com/japan/msdn/thisweek/step7/MasterPage/default.aspx
マスターページとは何ぞやっていう部分はよくわかると思いますが、マスターページの入れ子は結局デザイナが使えないって言うあまりにもあまりにもな仕様なのでお勧めできません。
#おそらくうまく管理すれば、同じようなマスターページを作成することで解決できるでしょう。
#デザイナが使えないのは・・・・